دانلود پایان نامه ارشد : بررسی شاخصهای پیری و ردیابی ژن آلفامانوزیداز مرتبط با پیری در چند رقم گیلاس |
معنیدار نبود اما بین رقم تکدانه تیمار شده و تیمار نشده با اسید آبسیزیک اختلاف معنیداری در روز 15 و 20 مشاهده گردید. با توجه به این نتایج، میتوان نقش اسید آبسیزیک را در ایجاد تغییرات کیفی و همچنین تاثیر بر روند پیری میوهها، مورد توجه قرار داد. در بخش بیوتکنولوژی، ژن آلفامانوزیداز (یک ژن مرتبط با پیری) برای اولین بار، در پنج رقم مختلف گیلاس شناسایی و تعیین توالی شد. به این منظور، آغازگرهای رفت و برگشت ژن مورد نظر از طریق مراجعه به پایگاه داده NCBI و استفاده از توالیهای مربوط به ژن آلفامانوزیداز برای هلو و فلفل، با استفاده از کپی کامل cDNA هلو و فلفل طراحی شد. به علت زیاد بودن طول ژن سه جفت آغازگر طراحی شد گه این آغازگرها قادرند طول 3100 جفتباز را پوشش دهند. همچنین دمای اتصال آغازگرها با استفاده از برنامه گرادیانت PCR بدست آمد. بعد از استخراج DNA ارقام گیلاس، یک قسمت از ژن مذکور تکثیر، توالییابی (با استفاده از نرمافزار سنگر) و همردیفسازی توالیها انجام شد و نمودار دندروگرام مربوط به آن با استفاده از نرمافزار 3 View رسم گردید. بررسی و مقایسه توالیهای معکوس، شباهت و تفاوتهایی را در ارقام مختلف نشان داد که بر طبق آن ارقام پیشرس (ER)، پیشرس خارجی (FE) و دیررس (LR) دارای شباهت بیشتر بوده و در یک گروه قرار گرفتند. ارقام پیشرس قزوین (GH) و دومرس (MR) دارای تفاوت بیشتری نسبت به سه رقم اول بوده و با یکدیگر نیز تفاوت نشان داده و هرکدام به طور جداگانه یک گروه مجزا را تشکیل دادند.این تفاوتها میتوانند در عملکرد ژن و در نتیجه رفتار گیاه تاثیرگذار باشند. به عنوان مثال، با مطالعات بیشتر و استفاده از تکنیکهای مهندسی ژنتیک، میتوان علت زمانهای متفاوت رسیدگی و تفاوت در طول عمر انبارمانی موجود در ارقام مختلف گیلاس را در این اختلاف توالیها جستجو نمود.
واژههای کلیدی: گیلاس، اسید آبسیزیک، پیری، آلفامانوزیداز
فهرست مطالب
عنوان صفحه
1- مقدمه و كلیات………………………………………………………………………………………………………………….. 2
1-1- مقدمه…………………………………………………………………………………………………………………….. 2
1-2- اهداف…………………………………………………………………………………………………………………… 3
1-3- فرضیهها………………………………………………………………………………………………………………… 4
2- سابقه تحقیق…………………………………………………………………………………………………… 6
2-1- خاستگاه و گیاهشناسی گیلاس………………………………………………………………………………… 6
2-2- طبقهبندی ارقام گیلاس……………………………………………………………………………………………. 7
2-3- کیفیت میوه…………………………………………………………………………………………………………….. 7
2-3-1- آنتوسیانین……………………………………………………………………………………………………. 7
2-3-2- اسیدیته………………………………………………………………………………………………………… 8
2-3-3- مواد جامد محلول………………………………………………………………………………………….. 8
2-3-4- سفتی بافت…………………………………………………………………………………………………… 9
2-3-5- کلروفیل و کاروتنوئید…………………………………………………………………………………….. 9
2-3-6- کربوهیدراتها……………………………………………………………………………………………. 10
2-4- بلوغ و رسیدگی در گیلاس……………………………………………………………………………………. 10
2-5- انبارمانی گیلاس…………………………………………………………………………………………………… 11
2-6- فیزیولوژی تنفس…………………………………………………………………………………………………… 12
2-7- اسید آبسیزیک……………………………………………………………………………………………………… 13
2-8- پیری……………………………………………………………………………………………………………………. 14
2-9- کنترل ژنتیکی متابولیسم گیاه…………………………………………………………………………………. 14
2-10- آنزیم آلفامانوزیداز و نقش آن در رسیدگی…………………………………………………………….. 15
فهرست مطالب
عنوان صفحه
3- مواد و روش کار…………………………………………………………………………………………………………….. 18
3-1- زمان و مکان آزمایش…………………………………………………………………………………………….. 18
3-2- بخش بیوشیمیایی…………………………………………………………………………………………………. 18
3-2-1- مواد گیاهی…………………………………………………………………………………………………. 18
3-2-2- طرح آماری آزمایش…………………………………………………………………………………….. 18
3-2-3- اندازهگیری سفتی……………………………………………………………………………………….. 19
3-2-5- اندازهگیری آنتوسیانین………………………………………………………………………………… 19
3-2-6- اندازهگیری کلروفیل دم میوه………………………………………………………………………… 19
3-2-7- اندازهگیری مواد جامد محلول میوه……………………………………………………………….. 21
3-2-8- اندازهگیری اسیدیته قابل تیتراسیون میوه……………………………………………………….. 21
3-2-9- اندازهگیری قند…………………………………………………………………………………………… 21
3-2-9-1- مواد مورد نیاز…………………………………………………………………………………… 21
3-2-9-2- استخراج قند…………………………………………………………………………………….. 22
3-2-9-3- اندازهگیری قند کل……………………………………………………………………………. 22
3-2-9-4- منحنی استاندارد قند کل……………………………………………………………………. 23
3-2-9-5- اندازهگیری فروکتوز………………………………………………………………………….. 23
3-2-9-6- تهیه نمودار استاندارد فروکتوز……………………………………………………………. 24
3-3- بخش بیوتکنولوژی……………………………………………………………………………………………….. 25
3-3-1- مواد گیاهی…………………………………………………………………………………………………. 25
3-3-2- استخراج DNA…………………………………………………………………………………………. 25
3-3-3- طراحی آغازگرها………………………………………………………………………………………… 26
3-3-4- تکثیر قطعات انتخابی………………………………………………………………………………….. 27
فهرست مطالب
عنوان صفحه
3-3-5- ارزیابی محصول PCR به وسیله تکنیک الکتروفورز ژل آگارز…………………………. 28
3-3-6- توالییابی محصول PCR……………………………………………………………………………… 28
3-4- تجزیه و تحلیل آماری……………………………………………………………………………………………. 28
4- نتایج و بحث………………………………………………………………………………………………………………….. 30
4-1- تاثیر کاربرد پس از برداشت اسید آبسیزیک بر سفتی میوه گیلاس…………………………….. 30
4-2- تاثیر کاربرد پس از برداشت اسید آبسیزیک بر تغییرات آنتوسیانین میوه گیلاس…………. 33
4-3- تاثیر کاربرد پس از برداشت اسید آبسیزیک بر کلروفیل کل و کاروتنوئید دم میوه گیلاس 36
4-4- تاثیر کاربرد پس از برداشت اسید آبسیزیک بر میزان مواد جامد محلول میوه گیلاس…… 42
4-5- تاثیر کاربرد پس از برداشت اسید آبسیزیک بر میزان اسیدیته قابل تیتراسیون میوه گیلاس 45
4-6- تاثیر کاربرد پس از برداشت اسید آبسیزیک بر میزان قند کل و فروکتوز میوه گیلاس….. 48
4-7- استخراج DNA…………………………………………………………………………………………………… 53
4-8- نتایج حاصل از طراحی آغازگر………………………………………………………………………………. 54
4-9- تکثیر ژن آلفامانوزیداز در پنج رقم گیلاس………………………………………………………………. 54
4-10- بررسی نتایج حاصل از توالییابی و همردیفسازی توالیهای بدست آمده……………….. 56
4-11- روابط فیلوژنی توالیهای مورد بررسی………………………………………………………………….. 60
4-12- نتیجهگیری کلی………………………………………………………………………………………………….. 61
4-3- پیشنهادات…………………………………………………………………………………………………………. 62
فهرست منابع……………………………………………………………………………………………………. 64
مقدمه و كلیات
1-1- مقدمه
از دیرباز پدیدهی عمر یکی از مسائل مهم حیات بوده است. از اینرو افزایش عمر برای موجودات گیاهی، جانوری و یا انسان میتواند حائز اهمیت باشد.
پیری در گیاهان به عنوان مرحلهی نهایی نمو تعریف شده است. از مشخصههای بارز پیری کنترل روند تغییرات بسیار منظم و کنترل شده فعل و انفعالات فیزیولوژیکی است. از جمله مهمترین این رخدادها توقف فتوسنتز، تجزیه کلروپلاست، کاهش چشمگیر کلروفیل و شکستن پروتئینها و لیپیدها و سایر مولکولهای بزرگ میباشد (نواب پور و همکاران، 2003).
در میوههای فرازگرا اتیلن عامل اصلی پیر شدن میوه میباشد و کنترل اتیلن از مکانیسمهای اصلی جلوگیری از پیری در این میوهها است. اما گیلاس یک میوهی نافرازگرا است. این میوه دارای ارقام متفاوتی از نظر طول عمر میباشد که شناسایی عوامل دخیل در تعیین طول عمر در ارقام زودرس و دیررس میتواند منجر به افزایش طول عمر گیلاس گردد.
طی رسیدن میوه، دستهای از فرآیندهای بیوشیمیایی که از لحاظ ژنتیکی در گیاه برنامهریزی شدهاند رخ میدهد که باعث تغییر ویژگیهای میوهی نارس و تبدیل آن به میوهی رسیده میشود (برامل، 2006). همچنین بعد از برداشت محصولات، تغییرات مختلف ساختاری ادامه مییابند که در جهت تخریب بافت میوه عمل میکنند (یو و همکاران، 2003). نرم شدن بیش از حد میوهها مسالهای است که عمر پس از برداشت آنها را کاهش میدهد. در محصولات تراریخته با تغییر در بیان ژن پروتئینها و آنزیمهایی که بر ویژگیهای دیوارهی سلولی تاثیرگذار هستند، میتوان میزان فعالیت و تاثیر آنزیمهایی مثل پلی گالاکتوروناز را در روند رسیدگی و نرم شدن محصول بررسی کرد (برامل و هارپستر، 2001 و واکابایاشی، 2000).
نرم شدن و تغییرات بافتی طی رسیدن میوهها در هر گونهی خاص، ویژگیهای مخصوص به خود را داراست (برامل و همکاران، 2004). علاوه بر این، تحقیقات نشان داده است که آنزیمهای آلفامانوزیداز (α-Man) و بتادی ان استیل هگزوسامینیداز (ß -Hex) در رسیدگی و نرم شدن میوههای نافرازگرا نقش دارند (قوش و همکاران، 2010).
با توجه به نافرازگرا بودن میوهی گیلاس، مشخص نیست که بین ارقام زودرس و دیررس این میوه چه بخشی از ژنهای α-Man و ß-Hex و ژن توسعهی سلولی (EXP) باعث تفاوت در طول عمر انباری گیلاسهای زودرس و دیررس میگردد. همچنین مشخص نمیباشد که شاخصهای پیری بین دو رقم زودرس و دیررس چه تفاوتی از نظر فعالیتهای آنزیمی α-Man و ß -Hex، لیپاز، پروتئاز و همچنین مقادیر قند، مواد جامد محلول،
فرم در حال بارگذاری ...
[پنجشنبه 1398-07-11] [ 12:32:00 ق.ظ ]
|